【シンプル回答】英語でなんと言う？「脱いだ靴を揃えましょうね」

Keep your shoes in line after you take them off

“In line”は「一線に、列をなす、〜に従う」という意味があり、”Keep sth in line”で「〜を揃える、並べる」となります。

”Take them off”の”Them”はこの文の”Shoes”を表します。

ネイティブが言う”Take them off”の発音はとても聞き取りづらいのでそちらも気をつけましょう。